В ходе проверки специалистами управления были выявлены грубые нарушения требований действующего законодательства, в том числе осуществление религиозной деятельности по распространению и обучению религии «Сайентология», неравноправное положение членов организации в связи с действием системы взносов в зависимости от степени овладения учением Лафайета Рона Хаббардаи т.д.
Так, организация занималась направлением людей в религиозное объединение «Сайентологическая Церковь Москвы», участия в обрядах, а также распространением и внедрением учения Хаббарда «Дианетика и Сайентология». Данное учение, по заключению экспертов, признано религиозной деятельностью, осуществление которой в соответствии с нормами федерального законодательства не предусмотрено.
Кроме того, в нарушение закона в Положении о членских взносах Гуманитарного центра «Дианетика» было указано, что время членства граждан в организации зависело от размера уплаченных взносов.
В связи с выявленными нарушениями закона прокурор Алтайского края в октябре 2007 году обратился в суд с исковым заявлением о ликвидации данной организации. Требования прокурора удовлетворены в полном объеме. Решение суда вступило в законную силу. После поступления решения в Управление Минюста России Барнаульская городская общественная организация «Гуманитарный центр “Дианетика” будет исключена из единого государственного реестра юридических лиц, т.е. ликвидирована.