В соответствии с инвестиционной программой ОАО «РЖД», в 2009 году на развитие Алтайского отделения ЗСЖД затрачено 1 млрд. 655 млн. рублей. Средства направлены на модернизацию объектов инфраструктуры транспортных направлений, строительство и реконструкцию зданий и сооружений, развитие производственного потенциала.
В частности, в 2009 году завершена механизация третьей тормозной позиции на станции Алтайская; реконструкция парка приема и удлинение приемоотправочных путей; а также реконструкция верхнего строения железнодорожного пути на перегоне Батунная-Заринская.
Кроме того, завершено строительство моста через реку Обь в городе Камень-на-Оби, пешеходных мостов в городах Камень-на-Оби и Алейск; реконструкция дома отдыха локомотивных бригад на станции Ребриха и первой очереди вокзала на станции Бийск; учебного корпуса дорожно-технической школы на станции Кулунда, монтаж охранно-пожарной сигнализации и установка автоматического пожаротушения на станции Алтайская.